Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms