Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLOD1Q02809 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms