Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms