Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPCQ01831 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPCQ01831 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPCQ01831 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms