Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms