Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms