Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK6Q00534 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms