Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms