Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRP54P61011 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRP54P61011 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRP54P61011 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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