Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFC1P60507 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms