Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBASH3AP57075 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms