Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms