Protein–RNA interactions for Protein: P54098

POLG, DNA polymerase subunit gamma-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLGP54098 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLGP54098 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLGP54098 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLGP54098 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLGP54098 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLGP54098 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLGP54098 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms