Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms