Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms