Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms