Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ME1P48163 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ME1P48163 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ME1P48163 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ME1P48163 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ME1P48163 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ME1P48163 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ME1P48163 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ME1P48163 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ME1P48163 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ME1P48163 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ME1P48163 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ME1P48163 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms