Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRATP43155 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRATP43155 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms