Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR1BP42025 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms