Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms