Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GJA4P35212 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GJA4P35212 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA4P35212 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms