Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms