Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms