Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBL1P28749 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBL1P28749 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBL1P28749 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms