Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms