Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5A1P25705 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms