Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms