Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

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Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NF1P21359 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NF1P21359 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NF1P21359 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NF1P21359 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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NF1P21359 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NF1P21359 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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NF1P21359 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NF1P21359 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NF1P21359 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NF1P21359 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NF1P21359 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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NF1P21359 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NF1P21359 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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