Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF1BP20333 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms