Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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CCL3L1P16619 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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