Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC087762.1-201ENST00000559755 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms