Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MCF2P10911 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MCF2P10911 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MCF2P10911 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MCF2P10911 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MCF2P10911 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MCF2P10911 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCF2P10911 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCF2P10911 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCF2P10911 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCF2P10911 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCF2P10911 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCF2P10911 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCF2P10911 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCF2P10911 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MCF2P10911 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCF2P10911 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCF2P10911 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCF2P10911 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms