Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms