Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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