Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTPRCP08575 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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