Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms