Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2P04141 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF2P04141 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms