Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms