Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DXG7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms