Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KNCNA6PVL3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms