Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms