Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms