Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms