Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC78A2IDD5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms