Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms