Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6M4

CSNK1G3, Casein kinase I isoform gamma-3, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3Q9Y6M4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CSNK1G3Q9Y6M4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CSNK1G3Q9Y6M4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CSNK1G3Q9Y6M4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CSNK1G3Q9Y6M4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CSNK1G3Q9Y6M4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CSNK1G3Q9Y6M4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CSNK1G3Q9Y6M4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CSNK1G3Q9Y6M4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CSNK1G3Q9Y6M4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CSNK1G3Q9Y6M4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CSNK1G3Q9Y6M4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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CSNK1G3Q9Y6M4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1G3Q9Y6M4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms