Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms