Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCA2Q9UQC9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA2Q9UQC9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms