Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGSF9BQ9UPX0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 870.1 ms