Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1BQ9UPS6 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms